一言以蔽之：陽明大學和交通大學合併為陽明交大，新校徽也融合了二所學校的特色。
2019年，陽明大學和交通大學兩校校務會議通過合併計畫書，於2021年2月1日正式合併為陽明交通大學，簡稱陽明交大。下圖左上是原陽明大學校徽，左下是原交通大學校徽，右邊則是合併後陽明交大的新校徽。
這個新logo中間的主體，融合了陽明大學的『蛇杖』和交通大學的『鐵鎚』，蛇杖是醫療之神阿斯克勒庇俄斯所執之杖（Unicode還有收錄這個字⚕），新校徽把木棒（象徵脊椎骨）換成了鐵鎚，從單蛇纏杖變成單蛇纏鎚，網友暱稱這是畫蛇添鎚或是蛇神之鎚。
logo上半維持了陽明大學飛翔的意象，也表達了字母Ｙ（表示陽明）的形狀。logo下半則是採用了交通大學的鐵砧和鐵鍊，象徵下盤穩固。logo外圈則是保留交通大學的齒輪圍繞，表示不停運轉的意思。
交通大學的鐵書也被留了下來，但分成左右二區，左區為整齊的是中文線裝書（裝訂成『冊』的意涵），右側直立的是西文書，二區的書有學貫中西的含義。
另外，交通大學的ＥＳＡ，也分別隱含在中文線裝書（Ｅ）、蛇杖（Ｓ）、下方的鎚頭加火爐（Ａ），這三個英文字則是代表工程Engineering、科學Science、管理Administration。
這個新校徽在2022年12月就已經在校務會議通過了，但當時字體和顏色則沒有定案，主要的原因是陽明大學和交通大學的字型不一樣，比如說在大學路口掛的門牌，就是陽明二字維持舊的陽明大學字型，而交通二字維持舊的交通大學字型。至於顏色，雖然飛蛇和鐵鎚都是藍色系，但二所學校的藍還是有些不同。
在2023年5月，學校敲定把原來的二個藍色系增加綠色的成分，公佈了代表色為『群青』，有「青出於藍、更勝於藍」的意味，代表理性冷靜、信任穩定、積極開拓、開放包容的特質。至於字體則是『書法』，如圖中所示，上半是舊的二校字型，下半是新的書法字型。
